石英砂選礦提純工藝流程很多，一般視石英中雜質的種類、含量、賦存狀態以及產品質量要求等確定，常見的石英砂選礦提純工藝流程如下:
(一)擦洗---分級、脫泥
石英砂在風化沉積成礦過程中，大量粘土性礦物和鐵質在石英表面形成膠結物或粘連礦物。采用擦洗---分級、脫泥工藝去除粘土雜質礦物、泥質鐵及部分薄膜鐵則是這類石英提純常用的工藝流程。如四川江津石英巖礦采用該工藝降除-0.1mm細泥和鐵質，使得二氧化硅從85.4%提高到97.4%，三氧化二鐵由原來的0.63%降低到0.165%。該工藝一般作為原礦入選前的預處理工藝，對泥質性雜質礦物進行有效脫除。
(二)擦洗—脫泥—磁選
一般而言，石英常見雜質礦物，如褐鐵礦、電氣石、赤鐵礦和黑云母等弱磁性礦機磁鐵礦等強磁性礦只有采用磁選工藝才可降除、實際生產中，多采用濕式強磁機進行選別，磁場強度約在13000奧斯特左右。某地湖湘沉積硅砂在經擦洗脫泥后，砂中含三氧化二鐵為0.36%，利用SHP-500型濕式強磁機對上述擦洗脫泥砂進行提純，可以獲得三氧化二鐵含量為0.16%。
(三)棒磨擦洗—脫泥---磁選—浮選---酸浸
石英砂原礦在經擦洗、磁選和浮選分離后，賦存較低的雜質礦物顆粒(包括單體、集合體)已基本上被清除干凈，二氧化硅純度一般可以達到99.5%-99.9%，基本上可以滿足石英砂大多數工業用途。但要求進一步作為超高純石英，就必須對以斑點和包裹體形式連生在石英顆粒表面上的雜質做酸浸處理，根據其不同的工業用途對石英不同雜質礦物(Fe、AL、Ti、Cr)的要求，進行不同濃度、配比的混合酸酸浸處理，如蘄春某石英巖礦的二氧化硅含量為99.76%，含細小包裹體，主要雜質礦物Fe、AL、Ti等以粘土礦物和鐵的氧化物形態存在。在經過棒磨擦洗—脫泥---磁選---浮選---酸浸工藝后，獲得二氧化硅含量為99.99%以上的高純石英。
(四)加藥高效強力擦洗—分級脫泥---磁選
通過對云南某石英提純做了詳細深入的實 驗研究之后，我們先創造性的使用加藥高效強力擦洗—分級脫泥—磁選這一新的提純工藝，并獲得成功。該工藝是對現有擦洗設備的結構進行了改進，優化了技術參數，通過加藥高效強力擦洗和分級脫泥可除去80%以上的雜質鐵和鋁礦，磁選主要是除去含鐵雜質礦物。通過該流程處理后，可獲得二氧化硅≥99.8%，三氧化二鐵≤0.023%，三氧化二鋁≤0.05%，二氧化鈦≤0.02%的優質精制石英砂，達到了一級光學玻璃用砂的要求，并且精砂的產率高達73%，而棒磨擦洗產率僅為49%，二氧化硅回收率為72.8%。再進行進一步的復選和酸浸處理，能獲得二氧化硅≥99.9%，三氧化二鐵≤0.005%，三氧化二鋁≤0.05%，二氧化鈦≤0.02%的高純石英，這一工藝的采用，克服了棒磨擦洗帶來的鐵質二次污染，產率低等缺點。